香港回归之后，警方为了维护香港的社会治安，打击黑帮势力，安插了1000多名卧底进入各类黑社会组织中，其中又以气焰最劢的洪兴社团为主要打击目标。早年做过卧底的韦定邦督察为这次代号“百年孤寂”行动的总指挥。洪兴社团的龙头老大虽然年事已高，却深谙权利之术，很好地平衡着社团内各方的利益，自己却并不直接参与其中，因此一直令警方束手无策。
各种犯罪活动主要由四个人控制：华超、黎继祥、钟孝礼、游志标。警方的渗透瓦解了他们四人表面看来稳定的关系，令他们感到草木皆兵，为求自保开始把刀伸向了对方。黎继祥因为钟孝礼的陷害被社团的杀手刺死，曾经是韦定邦警校同学的华超，在儿子被钟孝礼所伤后重新成为卧底，钟孝礼也难逃社团内部了清洗。最终，在潜伏于社团各处的卧底的配合下，洪兴社团中的大小头目一一落网，这个不可一世的犯罪社团被警方彻底摧毁。