《康熙王朝》创下了大陆电视剧在宝岛台湾的最高收视率，超过了以往《武则天》《雍正王朝》和《大宅门》。此前，颇获好评的《大宅门》在台湾的收视率达到1.7，一度成为大陆电视剧的收视“冠军”；而《康熙王朝》的平均收视率达到2.8，很快就取代了它的“冠军”位置。
清顺治十八年，恶疾天花袭击皇宫，皇帝爱妃命丧黄泉，顺治痛不欲生 ，立意遁入空门。危急之际，孝庄太后力挽狂澜，下令“改朱批，行蓝批” ，并将大病初愈年仅八岁的玄烨推上龙座，成为康熙皇帝。康熙即位后，鳌拜等权臣威迫有加，连孝庄太后也只好含辱。鳌拜“亲政” 开始，康熙改归皇权，权臣竟图谋废君改朝，康熙被迫殊死相争，最终智擒鳌拜，肃清政敌。
吴三桂等“三藩”拥兵自重，独霸一方，康熙年轻气盛，下旨撤藩，引发三藩之乱。朝廷兵将屡被吴三桂击败，明后裔朱三太子也趁机举起“反清复明”的大旗，太监造反，宫廷大乱。康熙陷入绝望，意欲退位，在孝庄太后的怒斥与激励下，康熙重振精神，起用汉臣周培功，与吴三桂拼死一搏，取得了最后胜利。
中国康熙时代，已是国富民强，一片盛事景象。
郑成功后裔郑经割台湾岛自立，不肯归降；蒙古葛尔丹也磨刀霍霍，推崇元大都立誓杀回北京。康熙先安抚葛尔丹，暂缓西北局势；然后起用名将施琅一举收复台湾，继而调转枪头率20万大军，在辽阔的草原上进行殊死的决战，全面消灭葛尔丹的余部，完成了中华民族版图的统一。
班师凯旋以后，孝庄太后归天，太子与权臣结成同党，意欲提前即位。康熙废除太子，引发夺嫡之争。
“千叟宴”上，康熙即宣布“立储”遗旨，却猝死在龙座上，诏书随风飘落玉阶，无人知晓它的神秘。