未来的日本,有许多拥有“E”能力的能力者们,并未发现自己的超能力每天过着平常人的生活。经常会搞坏自己周围电器并为此烦恼的OL 美晴。某天,忽然在她身边出现了数名男性,他们说美晴很危险并要把她带走!这时,身着身上流动着虹色战斗服的少女2人组出现了,她们以枪和身体为武器,击败了意欲绑架美晴的男子们,原来两人也是超能力者!她们分别是寡言的E能力者君塚麻织(17岁)和富有朝气的E能力者海老原千波美(22岁)(第一部中的女主人公)2人围绕E能力者的开始向美晴展开介绍,原来2人属于想让E能力者适应社会的保护组织,而刚才的男子则属于想要隔离E能力者的激进组织......E能力者与普通人类到底能够共存还是对立呢?大家拭目以待